一、徇私舞弊抵扣税款罪如何处罚?
徇私舞弊抵扣税款罪应当是按照5年以下的有期徒刑或者是拘役来进行处罚，徇私舞弊抵扣税款罪的判刑，是根据《刑法》第四百零五条 【徇私舞弊发售发票、抵扣税款、出口退税罪】税务机关的工作人员违反法律、行政法规的规定，在办理发售发票、抵扣税款、出口退税工作中，徇私舞弊，致使国家利益遭受重大损失的，处五年以下有期徒刑或者拘役;致使国家利益遭受特别重大损失的，处五年以上有期徒刑。
【违法提供出口退税证罪】其他国家机关工作人员违反国家规定，在提供出口货物报关单、出口收汇核销单等出口退税凭证的工作中，徇私舞弊，致使国家利益遭受重大损失的，依照前款的规定处罚。
二、徇私舞弊抵扣税款罪与它罪的区别是什么?
(一)区分罪与非罪的界限
认定徇私舞弊发售发票、抵扣税款、出口退税罪与非罪的界限，除认真把握法律对本罪主体、主观方面、客观方面的规定外，还要注意查明是否致使国家利益遭受重大损失。只有致使国家利益遭受重大损失的行为，才构成本罪。对于虽违法办理了发售发票、抵扣税款、出口退税，但被及时发现，没有造成损失的，不以犯罪论处，而应由有关主管部门依法追究其行政责任。
(二)区分本罪写诈骗罪、骗取国家出口退税款罪、偷税罪、非法出售增值税专用发票罪等犯罪的界限
行为人和办理发售发票抵扣税款、出口退税工作中的徇私舞弊行为，往往会在实际上为他人实施诈骗、骗取国家出口退税款、偷税、非法出售增值税专用发票等犯罪起到帮助作用，因此，必须注意划清本罪与这些犯罪的界限，其关键在于查明行为人主观上是否与这些犯罪分子具有共同的犯罪故意。如果查明行为人主观上与诈骗、骗取国家出口退税款等犯罪分子具有共同犯罪的故意而相互勾结，那么，其在客观上所实施的非法办理发售发票、抵扣税款、出口退税行为就属于诈骗、骗取国家出口退税款等犯罪的帮助犯，应当以这些犯罪的共犯定罪处罚，而不再按本罪处罚。
在当代的社会如果存在徇私舞弊抵扣税款这种行为的话，将会按照我们国家《刑法》当中的规定对此进行一定的处罚，通常情况之下是需要按照5年以下的有期徒刑来进行处罚的，当然的，这也是需要根据所造成的后果严重程度来做出一个不同的处理，比如说遭受重大损失的情况之下，将会按照5年以下有期徒刑的处罚。
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相关内容：非法出售发票罪的立案标准是什么?
非法出售发票罪，是指违反发票管理规定，非法出售各种不能用于出口退税、抵扣税款的发票的行为。此罪的立案标准是什么，怎么处罚?详情请看下文。
立案标准
刑法第209条第4款规定：“非法出售第3款规定以外的其他发票的，依照第2款的规定处罚。"即非法出售第3款规定以外的其他发票的，处2年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单 处1万元以上5万元以下罚金;由此可见.刑法对本罪的起刑点没有规定具体的数量标准。根据最高人民检察院、公安部《关于经济犯罪案件追诉标准的规定》的有关规定，“非法出售普通发票50份以上的，应予追诉。”这里的“普通发票”是指不能用于骗取出口退税、抵扣税款的普通发票，但发票本身是真的。如果出售的是假发票，则不按本罪处理.构成犯罪需要追究刑事责任的，应当以出售非法制造的发票罪立案追究。无论行为人是一次还是几次实施非法出售普通发票的行为，只要发票数量累计达到50份以上的，公安机关就应当立案侦查。
认定
注意区分罪与非罪的界限。(1)从犯罪客观方面来看，并不是行为人非法出售普通发票的行为都以犯罪论处，必须达到一定的数量标准才能构成本罪。非法出售普通发票50份以上的，应予追诉。对于未达到上 述标准的，可由有关部门给予行政处罚。(2)出售后他人是否使用，是否牟利，不影响本罪的成立。如果既实施出售行为，又实施虚开行为，应该数罪并罚。(3)购买增值税专用发票的行为属于犯罪，刑法单独规定了一个罪名，但购买普通发票刑法没有规定。如果行为人仅仅实施购买普通发票行为的，不能以犯罪论处。如果购买后又进行出售，则可以定非法出售发票罪。
量刑
根据刑法第209条第3款、第4款的规定，犯非法出售普通发票罪的，处2年以下有期徒刑、拘役或者管制.并处或单处1万元以上5万元以下罚金;情节严重的，处2年以上7年以下有期徒刑，并处5万元以上50万元以下罚金。
根据刑法第211条的规定，单位犯本罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照对自然人犯本罪的处罚的规定处罚。
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