刑事案件侦查终结的处理程序包括：如确认犯罪行为得到充分证实且证据确凿，应向同级检察机关提交起诉建议书及相关资料，由其作出是否起诉的判定。若因不足以追究刑事责任而撤销此案，或犯罪嫌疑人已获批捕则须立即解除羁押状态，明确许可逮捕审查的人民检察院也将收到相关档。当侦查过程中出现某些未明了或证据缺陷时，也可能需要重新调查。但补充侦查不得超过两次上限。因此，无论何种情况下的侦查末尾处置均需严格遵循法典与证据原则，以维护司法公正和尊重当事人之权利权益。
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