首先，二者发挥作用的领域不同，想象竞合犯是一种罪数形态，故想象竞合犯理论主要是解决犯罪行为触犯几个罪名，如何处罚的问题;而法条竞合犯主要是法律的适用问题，代表了法条间的关系，是在法条之间因有错综复杂的重合关系而导致均能对一行为进行评价时，如何选择一个最恰当、最全面的罪名的问题，故中国理论界历来有将其放入犯罪形态研究，还是放在刑法各论里研究的争论。
其二，想象竞合犯如前所述是特殊的数罪而与一罪相区别，而法条竞合系“同一犯罪行为，而触犯数法律时，仅适用一法律而排斥他法律，其罪之本身为单纯之一罪”，故将二者并列于罪数形态进行研究时亦有显著区别。
其三，“想象竞合犯中规定不同种罪名的数个法条之间发生关联，是以行为人实施特定的犯罪行为为前提或中介即如前所述，此法条之间的联系是偶然的，于法律制定时难以预见;而法条竞合犯的出现，从根本上讲是取决于某些《刑法》法条规定的犯罪构成具有重合关系的现实状态的必然结果，于法律制定时即可预见，通过对法律条文的研究亦不难认识，从一定程度上讲，数法条之间的联系是必然的，与犯罪行为的发生与否无关。
其四，从处罚原则上讲，对想象竞合犯采取的是从一重罪处罚的原则;而对于法条竞合犯，则根据各法条之间竞合关系不同，采用特别法优于普通法、全部法优于部分法、复杂法优于简单法等原则，并不一定导致适用重法，一句话，就是选用最恰当的罪名处断。
涉及到想象竞合的，是司法机关需要根据实际的犯罪事实来追究犯罪分子法律责任的。在同一犯罪嫌疑人构成了想象竞合犯罪的，需要对不同的犯罪事实和罪名进行认定，最终的判决情况，一般是可以按照数罪并罚处理的。
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