员工未按常规离职流程擅离岗位，虽非违法，却触犯劳动合同及公司规定。解决方法如下：首当其冲，须尽快联系该员，探讨离职缘由，责令其回来完成离职手续。若联系不上，可依据公司规定，以无故缺勤等理由解雇，并书面告知。同时，妥善安排工作交接，防止对业务运营产生严重影响。在解除劳动关系时，务必遵守相关法律法规，保证程序合法性。例如，需保存员工无故缺勤的证据，如考勤记录等。如员工擅自离岗导致单位经济受损，可依法追究其赔偿责任。
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