检察院不起诉通常不会留下案底。不起诉分为法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉等情形。法定不起诉是指犯罪嫌疑人具有刑事诉讼法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定，这种情况下不会有案底。酌定不起诉是指犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定，一般也不会留下案底。证据不足不起诉是指经补充侦查后，仍然证据不足，不符合起诉条件的，人民检察院可以作出不起诉决定，同样不会产生案底。但如果犯罪嫌疑人以后又故意犯罪的，可能会被视为有前科。
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