从犯在逃时，主犯通常不能撤案。在刑事案件中，撤案的决定权在于司法机关，而非当事人。犯罪行为一旦发生，便进入刑事诉讼程序，该程序的启动基于维护社会秩序、保障法律公正实施等目的。即使从犯在逃，主犯也不能单方面决定撤案。因为犯罪事实已然存在，司法机关需依法对整个犯罪行为进行侦查、审查起诉及审判，以确定犯罪嫌疑人是否构成犯罪以及应承担何种刑事责任。从犯在逃并不影响对主犯的刑事责任认定和追究。司法机关会通过一系列侦查手段追捕在逃从犯，同时依据现有证据对主犯进行处理。若主犯主动配合司法机关，如实供述犯罪事实，积极协助追捕从犯等，在量刑时可作为从轻情节予以考虑，但撤案这一行为一般不会因从犯在逃而被允许。
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